请教LVDS稳定问题

McCrocodile

芯片是两片XC6SLX75T，有18对LVDS，有随路时钟，工作在600MHz；第一块FPGA上有2篇DDR3，第二块FPGA有4片DDR3，工作在800MHz。
LVDS在第十层，上下都是地层，线等长，工做了4块样板。FPGA1内部无端接，FPGA2内部端接。现在的现象如下：
有一块板子是全好的，整个板子都工作正常，可以正常使用。
有两块板子在FPGA1中下载完全的程序（包含DDR3操作），在FPGA2下载完全的程序（包含DDR3操作）不能正常工作，FPGA2上下载一个LVDS接收的测试代码，可以接收到数据，能恢复时钟。
还有一块板子只能在FPGA1和FPGA2上下载LVDS的收发测试代码（不包含DDR3操作）。

想请给一个测试方法，或者帮分析下问题。