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[转贴] Sentieon 2025.2 linux 支持集群

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发表于 昨天 12:32 | 显示全部楼层 |阅读模式

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Enabling Precision Data for Precision Medicine
Sentieon 软件忠于BWA、GATK、MuTect、MuTect2、STAR、Minimap2金标准的数学模型,在保证完全匹配GATK/BWA结果的前提下,计算效率提升15倍以上。Sentieon为大群组项目提供一站式Joint Calling解决方案,可同时处理10万个WGS样本的Joint Calling,无需中间步骤。大幅提升WGS/WES/Panel/ctDNA/RNA等基因数据分析效率。
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       Sentieon 致力于解决生物信息数据分析中的速度与准确度瓶颈,通过算法的深度优化和企业级的软件工程,大幅度提升NGS数据处理的效率、准确度和可靠性。       Sentieon为来自于分子诊断、药物研发、临床医疗、动植物研究等多个领域的合作伙伴和科研机构提供软件解决方案,共同推动基因技术的发展,实现“成就精准数据,服务精准医疗“的愿景。       毅硕科技(INSVAST)作为Sentieon Inc. 大中华区授权服务机构,我们将始终本着真诚的态度和专业的精神,坚持并维护Sentieon Inc. 愿景,为大中华区客户提供优质的服务。
      Sentieon为完整的纯软件二次分析解决方案,该方案涵盖了从基因比对到变异检测的全部流程,可同时用于胚系突变检测和体细胞突变检测。全面支持主流二、三代测序平台,包括illumina、MGI、PacBio、Nanopore、Genemind、IonTorrent、Ultima、Element等。

      Sentieon软件忠于BWA、GATK、MuTect、MuTect2、STAR、Minimap2金标准的数学模型,在保证结果完全匹配GATK/BWA金标准的前提下,分析效率提升10倍以上。Sentieon为大群组项目提供一站式Joint Calling解决方案,最大可处理10万个WGS样本的Joint Calling,无需中间步骤。为了方便用户自定义BAM流程,Sentieon提供了Python API Engine。提供UMI模块,替代Fgbio/picard,在更高精度的条件下UMI分析速度提升20倍。提供替代STAR的加速模块,为单细胞测序RNA-seq提供加速计算。

Sentieon DNAseq应用流程
Sentieon RNA Pipeline
Sentieon比GATK4要快5到20倍
Sentieon DNAseq结果与GATK结果保持一致
Sentieon 单次Calling最大10万个WGS样本
Sentieon提供Python API接口
解决方案 软件模块 软件兼容 行业认证 客户分布



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